莫干山的毛竹林面积为988公顷占山林面积的41.7 其他主要树种有金钱松 柳杉 黄山松 悬铃木 青冈 栎 石楠 枫香 杨桐等组成的常绿落叶针阔混交林 灌丛有茶等 低山 平原地带植被为毛竹 石竹 青冈 栎 冬青等 莫干山有森林灌丛 平原田野 沼泽水域 等3个主要生境 森林灌丛为主体，森林覆盖率为92 以 上 平原田野为农田开阔地 沼泽水域以莫干湖为主， 面积为467公顷 莫干山是浙江山地森林鸟类的重要栖息地 珍贵 濒危鸟类有国家II级保护动物小天鹅 鸢 苍鹰 赤腹 鹰 雀鹰 普通 红隼 白鹇 领鸺 m 斑头鸺 m 鹰 长耳 ，以及苍鹭 池鹭 斑嘴鸭 绿翅鸭 普 通翠鸟 家燕 金腰燕 水鹨 树鹨 绿鹦嘴鹎 白鹎 黑鹎 黑枕黄鹂 红胁蓝尾鸲 北红尾鸲 画眉 大山 雀 麻雀 白腰文鸟 八哥 松鸦 喜鹊 红嘴蓝鹊 灰头 c 黄喉 c 小 c等 莫干山有一种长着猴子脸 老鹰嘴，形貌奇特鸟， 当地人叫它猴面鹰，中文名叫做草 ^ 草 ^属猛禽益鸟 全山均有，生活在茂林中，常筑巢于岩洞或对洞昼伏夜 出，以鼠为食品 据调查夏季，一只猴面鹰可捕杀老鼠 1000多只 所以人称它为 会飞的猫 ，现已列为国家 二级重点保护动物